Sołtys: Jarmuła Waldemar
Wieś powstała dopiero na przełomie XVI-XVII w. jako przysiółek Duńkowic Wielkich. Miała charakter osady usługowo-handlowej a ludność trudniła się głównie flisactwem. Związane to było z usytuowaniem osady nad Sanem. Stąd dzieje wsi związane są ściśle z dziejami Duńkowic, z którymi jeszcze w XIX w. były związana własnościowo i terytorialnie. Założona została zapewne przez Drohojowskich właścicieli Duńkowic od ok. 1560 r. aż po koniec wieku XVIII.
W 1765 r. Józef Drohojowski, chorąży żydaczowski, dziedzic Michałówki i Duńkowic, założył tu parafię rzymsko-katolicką i ufundował drewniany, zachowany do dzisiaj kościółek p.w. Michała Archanioła, którego budowę ukończono przed 1775 r. Parafia obejmowała filie w Duńkowicach, Grabowcu, Nienowicach. Wierni obrządku greckokatolickiego należeli do parafii w Łazach, która posiadała filię w pobliskich Duńkowicach (znajdowała się tam drewniana cerkiew) w 1831 r., wraz z przysiółkiem Jamki, było ich 54 osoby.
W 1868 r. właścicielem obu miejscowości był Jan Urbański, około 1880 r. Alojzy Rybicki. W tym czasie w Michałówce było 55 domów zamieszkałych przez 328 mieszkańców. We wsi była jednoklasowa szkoła oraz cegielnia. Plan katastralny z 1849 r. rejestruje całkowicie drewnianą zabudowę o zasięgu niewiele mniejszym niż zabudowa obecna. Głównymi elementami zabudowy był kościółek z dzwonnicą cmentarz (w miejscu gdzie i obecnie) oraz usytuowany w północnej części wsi folwark.
Na przełomie XIX-XX w. właścicielem obu miejscowości był Żyd Jakub Bleicher, który zbankrutował. Prawdopodobnie wówczas nastąpił rozdział wsi, gdyż Duńkowice zakupił na licytacji Seweryn Friedman, a Michałówka w 1909 r. była własnością Emanuela Spetta.
W czasie I wojny światowej, wskutek ciężkich walk jakie toczyły się tu w 1915 r. o San, kościół uległ poważnym uszkodzeniom. Został odbudowany w 1916 r. W czasie II wojny światowej służył jako magazyn, gruntownie go odrestaurowano w 1970 r. W roku 2011 abp Józef Michalik poświecił odnowiony Kosciół pw. Św. Michła Archanioła. Po 3 letnim remoncie świątynia nabrała nowego blasku.